Национальный медицинский исследовательский центр реабилитации и курортологии

Ряд реорганизаций института произошёл в конце 90-х годов. «НИИ курортологии и физиотерапии» был преобразован в «Научный центр восстановительной медицины и курортологии» Минздрава России. Его руководителем стал профессор А.Н. Разумов. Название учреждения чуть позже уточнили — «Российский научный центр восстановительной медицины и курортологии» Минздравсоцразвития РФ. Поменялся и статус института, ставшего ведущим учреждением реабилитации и курортологии в стране.

Профилактика заболеваний и охрана здоровья, а также медицинская реабилитация стали основными направлениями деятельности Центра. Здание, построенное в 30-е годы, больше не соответствовало задачам и современным требованиям, поэтому его было решено снести. На том же месте построили многофункциональный оздоровительно-реабилитационный и научно-образовательный комплекс, директором которого в 2010 году стал заслуженный врач РФ В.А. Линок. Название института вновь подверглось изменению. Теперь уже «Российский научный центр медицинской реабилитации и курортологии» функционировал под этим наименованием 6 лет, с 2011 по 2017 годы. В 2014 году В.А. Линок на посту сменила профессор М.Ю. Герасименко.